一、凉山半细毛羊QTL作图研究进展(论文文献综述)
周明亮,杨平贵,吴登俊[1](2014)在《凉山半细毛羊3号染色体体重性状QTL定位研究》文中研究表明以四川凉山半细毛羊为资源参考群体,选择位于绵羊3号染色体上的9个微卫星标记,用Win QTL cart软件对凉山半细毛羊的5个体重性状进行QTL检测。结果显示:①在191家系中,检测到影响羔羊断奶重的QTL,位于110.01 cM,加性效应为6.860,解释表型变异为29.3%;②在190家系中,检测到影响断奶日增重的QTL,位于227.41 cM,加性效应为0.013,解释表型变异为1.7%;③未检测到影响羔羊初生重、育成体重和成年体重性状的QTL。
陈华丽[2](2013)在《四川省绵羊资源的发掘与评估初探》文中研究指明本试验通过文献资料整理以及绵羊生产性能测定对四川省的绵羊资源状况初步做了整合。川西南山地区主要分布有山地型藏绵羊和凉山半细毛羊,还有在布拖新发现的纯黑色的基因资源(暂名-布拖黑绵羊);西部高原区主要分布有藏羊品种中的高原型、山谷型绵羊以及贾洛藏绵羊。凉山半细毛羊纯种繁殖和改良当地羊表现良好,贾洛藏绵羊改良欧拉羊、甘加羊等草地型藏绵羊效果较好。山谷型西藏羊具有独特的生物学特性,其中在凉山州布拖县分布的布拖黑绵羊研究甚少。本试验在凉山随机选取凉山半细毛羊改良羊(凉山半细毛羊和山谷型藏绵羊的杂交一代)和布拖黑绵羊的母羊各五只,并对这两种羊的生长发育、屠宰性能、羊肉品质、常规营养、矿物质、氨基酸、脂肪酸、挥发性风味物质等进行分析。实验结果发现:凉山半细毛羊改良羊的生长发育指标除管围之外均比布拖黑绵羊要高。屠宰性能和羊肉品质方面,除眼肌面积和肌纤维直径外凉山半细毛羊改良羊均大于布拖黑绵羊。凉山半细毛羊改良羊的初水份、粗脂肪和热解值稍高于布拖黑绵羊,其他常规营养则少于布拖黑绵羊。布拖黑绵羊的铁、锌、钠、镁含量低于凉山半细毛羊改良羊;其余含量布拖黑绵羊较高。两种资源氨基酸含量丰富,在非必需氨基酸中,除胱氨酸外,布拖黑绵羊含量稍高于凉山半细毛羊改良羊;必需氨基酸中,布拖黑绵羊精氨酸、色氨酸、缬氨酸的含量稍高于凉山半细毛羊改良羊,其他必需氨基酸成分则低于凉山半细毛羊改良羊。凉山半细毛羊改良羊各种必需氨基酸含量占蛋白质的比例总体高于布拖黑绵羊(精氨酸除外)。布拖黑绵羊及凉山半细毛羊改良羊的脂肪酸主要由豆蔻酸、棕榈酸、棕榈烯酸、硬脂酸、油酸、亚油酸、花生酸和亚麻酸等构成。两种资源的主要挥发性成分为己醛、庚醛、1-辛烯-3-醇、2-戊基呋喃、2,3-辛二酮、辛醛、苯甲醛、壬醛等,不同羊只存在个体差异;布拖黑绵羊中检测到48种挥发性化合物,凉山半细毛羊改良羊中检测到56种挥发性化合物,两种绵羊挥发性成分中占主要地位的可能是对肉品风味贡献较大的醛类。四川省曾经引进的11个品种适应性总体较好。现有资料的整理中,各品种绵羊资源多数体质结实、结构匀称。生理生化指标有所差异,凉山半细毛羊呼吸数较高,罗姆尼羊的红细胞数含量相对最高,小尾寒羊血液中球蛋白含量、白细胞数和血清总蛋白含量相对较高;生长发育方面贾洛藏绵羊和凉山半细毛羊在本地羊中比较占优势,引入品种生长发育指标总体较好;繁殖性能方面凉山半细毛羊及引入品种较好;产肉性能方面贾洛藏绵羊、小尾寒羊和罗姆尼羊较好;培育品种凉山半细毛羊及引入品种苏联美利奴羊、高加索细毛羊、林肯羊、考力代羊的产毛性能较好,其中苏联美利奴羊剪毛量最高;高原型西藏羊、湖羊和小尾寒羊有较高的皮用价值。四川省绵羊资源的遗传多样性较丰富,其中西藏羊、凉山半细毛羊、新疆细毛羊、湖羊和小尾寒羊多样性研究最多,加上一些没有搜集到的以及尚未研究的遗传多样性,四川绵羊资源有很大的发掘和评估价值。目前,四川省绵羊资源调查描述表格的设计已经完成,对已经存在的品种资源进行了试填,四川省绵羊资源监测系统建设需在此基础上进一步完善,课题组将继续对四川省绵羊资源的发掘、评估与利用做进一步研究。
张翔宇[3](2009)在《绵羊胴体成分性状QTL的元分析及相关基因的克隆、时空表达谱分析》文中指出胴体成分是绵羊育种中一个非常重要的经济性状。与其它复杂的生理性状相比,表型值的测定也相对简单。因此,针对胴体成分及其相关性状的QTL定位已经有了许多报道。综合这些信息将有助于深入理解胴体成分性状的遗传变异机制。本研究对156个影响胴体成分的QTL进行了综合分析。先将原始的QTL进行映射,并用元分析法对映射后的QTL进行分析,产生了12个MQTL。这些MQTL与原始的QTL相比,定位的准确性都得到了提高。然后,对MQTL和绵羊已经定位的候选基因进行关联分析。同时,收集牛的胴体成分候选基因,通过比较基因组图定位到参考图谱中,建立与MQTL的关联。通过文献检索和收集,共检索到13篇文献,对检索到的文献进行QTL的信息收集,共收集到156个影响绵羊胴体成分的QTL,涉及9个品种,共计9127个个体。其中,影响胴体体重(CW)的QTL 12个,影响脂肪性状(FAT)的QTL 50个,影响活体体重(LW)的QTL 33个,影响肌肉性状(MUS)的QTL 61个。经映射分析,将搜集的绵羊胴体成分相关的QTL整合在一张遗传图谱上。映射后的QTL没有覆盖整个基因组,而是分布在1,2,3,4,5,6,8,11,18,20,21号染色体。并且在这些染色体上的QTL分布明显不平衡。2号和18号染色体包括了56%的QTL,2号和18号染色体均包含了25个以上的QTL,而4,8,11和21号染色体上的QTL数目都未超过3个。同时,不同染色体上的分布方式也有所不同,有的表现为簇集在一定区域内。映射后的156个QTL中,有10个是单个QTL,剩下的146个QTL经元分析,产生了12个MQTL。最准确的MQTL分别位于2号和18号染色体上,相应的CI值为4.37 cM、8.98 cM和4.35 cM。MQTL的估计CI值,降低了原始QTL的平均CI值,降低的范围为0.85~72.65 cM。QTL置信区间平均减少40.54 cM,增加了QTL定位的准确性,有利于相关候选基因的鉴定。1号染色体上共有2个元QTL,MQTL1(215.86 cM)和MQTL2(294.37 cM)。2号染色体上共有3个元QTL,MQTL3(95.41 cM)、MQTL4(143.44 cM)和MQTL5(244.58cM)。3号染色体上共有2个元QTL,MQTL6(19 cM)和MQTL7(243 cM)。5号染色体上有1个MQTL8(0.23 cM)。6号染色体上有1个元QTL9(1.06 cM)。18号染色体上共有2个元QTL,MQTL10(76.18 cM)和MQTL11(100.4 cM)。20号染色体上有1个元QTL12(65.26cM)。根据报道的结果,经映射到参考图谱后,有两个已知的绵羊候选基因与MQTL关联。牛基因组中控制胴体成分性状的基因13个,使用虚拟绵羊图谱,3个基因与元QTL存在关联关系。选择与MQTL4关联最紧密的肌肉生成抑制素(MSTN),以及没有与任何MQTL关联的生肌决定因子(MRF)家族作为功能候选基因。采用荧光定量PCR技术,检测了MSTN和MRF家族在出生后绵羊肌肉中的表达方式及表达的组织特异性,以确定这些基因在胴体组成中的具体功能。荧光定量结果表明:肌肉组织中MSTN mRNA的表达量显着高于大脑、心脏和肝脏组织(P<0.05)。肝脏组织中MSTN mRNA的表达量显着低于肌肉和大脑组织(P<0.05)。大脑组织和心脏组织间MSTN mRNA的表达量差异不显着。出生后到60日龄背最长肌中MSTN mRNA的表达量不断下降,60日龄时最低,60日龄到105日龄开始上升。105日龄到195日龄保持在一个相对稳定的平台期。之后又开始下降。MRF家族仅在骨骼肌中表达,在非肌肉组织均不表达。在所研究的出生后的肌肉发育过程中,MYOD、MYOG和MYF5在出生不久的骨骼肌中表达量很高,但随年龄的增长,处于不断的减少中,虽然,MYF6 mRNA的表达量105日龄最高,但差异不显着。同时MYF6在研究的整个过程中,表达量没有呈一个固定的变化趋势,基本维持衡定。这一结果表明,MYF6在维持成年肌肉中发挥作用。MYOD、MYOG、MYF5和MYF6的差异表达可能是控制不同肌细胞发育和肌纤维类型的重要方式。同时,采用RT-PCR方法,得到了MYOG和MYF6的CDS全序列。绵羊MYOG基因CDS区核苷酸序列与普通牛之间的同源性为96%。而绵羊MYF6基因CDS区核苷酸序列与普通牛之间的同源性高达99%。本研究筛选出了5个与MQTL关联的候选基因,这些基因可能具有较大的研究价值。结果表明,结合元分析法和比较基因组图是对所研究性状进行新候选基因鉴定的有效方法。另外,MQTL附近的标记有助于标记辅助选择。
童恒星[4](2008)在《凉山半细毛羊遗传育种数据仓库构建及其数据挖掘》文中提出本研究采用凉山半细毛羊资源参考家系从1997~2007年间的相关育种资料(系谱、经济性状和分子遗传标记)作为研究对象。面向动物遗传参数评估工作的实践需求,运用数据仓库技术构建一套遗传参数估测系统,供遗传育种实践作决策支持。本研究数据源有亲权鉴定出的系谱数据、表型鉴定数据、分子遗传标记和QTL定位。对数据源分别实施校对记录,删除缺失记录,审查系谱等数据清洗后,消除所有数据噪声。面向遗传参数估测的实际需求,定义和划分了系谱、羊毛性状和体重性状等主题域。数据粒度层次划分遵循全局数据仓库的需求,遗传育种细节数据都划分为低粒度,表型值部分划分为中等粒度数据或者高等粒度数据。在从属数据集市当中,部分数据采用了双重数据粒度划分层次。按照确定好的系统边界,把遗传育种数据进行分区处理和预处理。相关数据源(结构化数据、非结构化数据)经过抽取、转换和装载之后,转入关系数据库中存储。然后,面向主题域抽取数据构建从属数据集市。本研究的数据仓库采用雪花型概念模型设计。依照动物遗传参数评估特点设计数据仓库的逻辑模型。数据仓库的物理设计和实现是运用多维数据模型理论。采用多维数据模型实现三个从属数据集市,即系谱数据集市、羊毛性状数据集市和体重性状数据集市。从属数据集市是关系型数据仓库当中分离出来的。数据集市的每一个维度存储一个数量遗传表型值。对每个数据立方体钻去、切片和旋转等操作来完成遗传参数汇总、聚集等工作,为决策实施服务。运用数据挖掘工具估测凉山半细毛羊的遗传参数,预测遗传进展、预测选择效果和杂种优势。生成的从属数据集市由数据挖掘工具检验其性能,表明数据仓库系统能够完成凉山半细毛羊遗传参数估测的实践工作。
郭婷婷,张英杰,刘月琴[5](2008)在《绵羊经济性状QTL定位的研究进展》文中指出在畜牧业生产中,大多数与生产性能有关的重要经济性状都属于可以度量的数量性状。与传统的孟德尔性状(质量性状) 相比,数量性状有自身的特殊性,经典的遗传学研究方法己不适用,只能用统计学的方法加以研究。对一个数量性状的完整描述必须考虑到影响它的所有基因的特性,包括其基因频率和基
余敏[6](2007)在《凉山半细毛羊资源参考群信息数据库的初步构建》文中指出本研究以凉山半细毛羊为主要的研究对象,结合资料,系统整理了凉山半细毛羊资源参考群有关信息(系谱资料、生产性能资料和遗传信息)资料。实验研究人员每年到凉山州布拖县四川凉山半细毛羊核心育种场进行现场鉴定,获得羊毛性状和体重性状的表型资料数据,以及实验研究得到实验数据,将收集的数据整理后构建数据库。根据实际需要,研究了其信息系统的开发技术,介绍了凉山半细毛羊信息系统的实现。该系统有助于管理和实验人员迅速方便地获取相关信息,进而提高工作效率、改善科研和管理手段。开发中选择Microsoft中的Access数据库,用Macromedia Dreamweaver MX 2004,HTML(Hypter Text Markup Language)和FrontPage作为开发工具制作Web系统,实现ASP(Actire Server Pages)技术。主要内容包括:1.介绍了管理信息系统的基本概念,回顾了数据管理方式的发展历史,对各种生物数据库进行了较详细的介绍。2.介绍了凉山半细毛羊的种质特点以及目前的研究情况。3.介绍了系统的整体设计情况,探讨了系统数据库结构以及模块划分。4.介绍了各模块的功能实现流程及实现步骤。5.介绍了凉山半细毛羊Web系统的设计及开发情况。论文最后对完成的工作进行了总结,指出了今后的研究工作。
郭蓉[7](2007)在《微卫星标记多态性及其与凉山半细毛羊体重性状相关关系研究》文中指出本研究以凉山半细毛羊原种场的2001~2003年度的凉山半细毛羊个体为研究对象,采用聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳银染法和PCR技术相结合的方法,利用微卫星标记技术,以位于绵羊基因组3号染色体和X染色体上的共计15个微卫星标记来研究该群体的5个体重性状与微卫星标记之间的相关关系。5个体重表型性状为:初生重(Birth weight),断奶重(Weaning weight),断奶日增重(Weaning daily gain),1.5岁体重(1.5-year weight,1.5-YW)及2.5岁体重(2.5-year weight,2.5-YW)等5个体重性状。对所研究群体的5个体重性状进行表型相关分析。初生重和断奶重的相关系数为0.2086,达显着水平,初生重和1.5岁体重,断奶重和断奶日增重,断奶重和1.5岁体重及断奶日增重和1.5岁体重之间分别达极显着水平,且相关系数均为正相关。在凉山半细毛羊15个微卫星标记遗传特性实验结果中,平均等位基因数为7个(3~12个),平均观察杂合度为0.6288,平均预期杂合度为0.7877,平均多态信息含量为0.7518,其中微卫星BMS0460的多态信息含量最高(PIC=0.842),而标记MILVET09的多态信息含量最低(PIC=0.569)。15个微卫星标记均表现为高度多态性,在分子水平上为该资源群体的研究提供了可靠的依据。通过SAS统计软件中的一般线性模型程序进行表型性状与15个微卫星标记的相关分析,有7个微卫星标记与部分体重性状存在显着或极显着相关。标记BMS0460的初生重差异显着(P<0.05),标记RM150的断奶重和断奶曰增重差异显着(P<0.05),标记BMS1953的2.5岁体重差异显着(P<0.05),标记BL0004和标记BMS1248的1.5岁体重差异显着(P<0.05),标记AE25的断奶日增重差异显着(P<0.05),标记BMC1009的1.5岁体重则差异极显着(P<0.01)。标记RM150同时和两个相关性状存在关联。对差异显着的标记进行不同基因型间各体重性状的多重比较。标记BMS0460的基因型EI、EH、DF对初生重影响显着。标记RM150基因型BB、DI和JJ对断奶重影响显着。标记RM150基因型EI、GG、DI和JJ,标记AE25的基因型AA对断奶日增重影响显着。标记BL0004基因型EE、CD,标记BMS1248基因型BC、AA,标记BMC1009的DI、CE、GI基因型对1.5岁体重影响显着。标记BMS1953基因型CF、CE和BD对2.5岁体重影响显着。
胡蓉[8](2007)在《微卫星DNA标记与凉山半细毛羊羊毛性状关系的研究》文中认为本试验选用绵羊基因组中第3号染色体上的13个微卫星标记和X染色体上的2个微卫星标记,结合PCR和复合电泳银染技术对凉山半细毛羊核心育种群6个父系组成的129只个体的7个羊毛表型性状进行标记—表型相关研究。7个表型性状为:断奶毛长(SL1),育成毛长(SL2),成年毛长(SL3),育成剪毛量(WY1),成年剪毛量(WY2),育成毛纤维直径(WFD1),成年毛纤维直径(WFD2)。对7个羊毛性状进行表型相关分析,育成毛长与成年毛长之间呈极显着正相关(P<0.01);育成剪毛量与成年剪毛量之间呈极显着正相关(P<0.01);育成毛细度与断奶毛长呈显着负相关(0.01<P<0.05),还与成年毛细度呈显着正相关(0.01<P<0.05);成年毛细度与育成剪毛量呈极显着负相关(P<0.01)。所选微卫星标记在凉山半细毛羊群体中平均检测到7.470个(5~11个)等位基因,平均多态信息含量为0.754(0.552~0.859),群体杂合度平均值为0.705(0.541~0.817)。15个标记均呈现高度或中度多态性,为该群体分子水平上的研究提供了可靠的依据。通过微卫星标记与表型性状的相关分析,结果发现9个微卫星标记对部分羊毛性状存在显着或极显着影响。其中标记BMS0460、BM3501、BL0004对断奶毛长影响显着(P<0.05),AE25对断奶毛长影响极显着(P<0.01);ILSTS22对育成毛长影响显着(P<0.05);Oarcp43、MILVET09对育成剪毛量影响分别为极显着(P<0.01)和显着(P<0.05);RM150、ILSTS22、ILSTS0049对成年剪毛量影响显着(P<0.05),MILVET09对成年剪毛量影响极显着(P<0.01);Oarcp43对成年毛细度影响显着(P<0.05),AE25对成年毛细度影响极显着(P<0.01)。通过对与表型显着相关的标记进行不同基因型间的多重比较,结果发现在标记BMS0460中,等位基因G对断奶毛长起增效作用,基因型GG、DG、BB为优势基因型。在标记Oarcp43中,基因型BD是育成剪毛量的优势基因型,基因型DD是成年毛细度的优势基因型。在标记BM3501中,Ⅱ是影响断奶毛长的优势基因型,等位基因Ⅰ为优势基因。在标记RM150中,等位基因F、C对成年剪毛量分别起增效和减效作用,基因型AF为优势基因型。在标记BL0004中,基因型CE、BC、EE为断奶毛长的优势基因型。在标记ILSTS22中,基因型DD、EF、DE是育成毛长的优势基因型,等位基因D起增效作用;基因型FF是成年剪毛量的优势基因型,等位基因F、E分别对成年剪毛量起增效作用和减效作用。在标记MILVET09中,基因型BB、AC、BC同时为育成剪毛量和成年剪毛量两个性状的优势基因型。在标记AE25中,基因型EG为断奶毛长的优势基因型,基因型EF为成年毛细度的优势基因型。在标记ILSTS0049中,基因型AG是成年剪毛量性状的优势基因型。
李辉[9](2006)在《凉山半细毛羊QTL定位初步研究》文中研究说明本研究以我国自行培育成功的凉山半细毛羊作为资源群体,对与实际生产密切相关的5个体重性状和8个羊毛性状进行了QTL连锁分析。体重性状分别是羔羊初生重、断奶重、断奶日增重、育成体重和成年体重;8个羊毛性状分别是断奶羊毛纤维长度、育成羊毛纤维长度、成年羊毛纤维长度、育成腹部羊毛纤维长度、成年腹部羊毛纤维长度、育成剪毛量成年剪毛量成年羊毛纤维直径。 本研究选择了绵羊1、2、3、9号染色体上的47个微卫星标记,引物经荧光标记进行多重PCR扩增,并在ABI310测序仪上进行检测。根据测定结果,剔除了14个扩增效果不好的标记,选择了33个标记进行分析。 Cervus2.0软件统计结果显示所选微卫星标记在凉山半细毛羊群体中等位基因在3~22个之间,群体杂合度为0.258~0.867,多态信息含量为0.245~0.853;各位点排除概率范围为0.137~0.728,累计排除概率达到了0.999999。只有一个标记是低度多态,其他标记均呈现高度或中度多态性,为该群体分子水平上的研究提供了保障。 利用所选的微卫星标记对试验个体进行了亲子鉴定,所选标记的累积非父排除概率(cumulative probability of exclusion,CPE)达到了99.999999%,最终确定了13个家系,试验个体总数为1003只,其中父母代480只、后代591只,最大家系为188家系(181只),最小家系为S259(20只)。 对试验群体的591个后裔的5个体重性状和8个羊毛性状进行了表型资料的简单统计分析。结果表明:初生和断奶性状与育成羊和成年羊的一些性状成显着相关,而且家系效应对某些性状有显着影响。 通过对所选标记进行遗传连锁分析,构建了凉山半细毛羊基因组1、2、3、9号染色体的遗传连锁图谱。连锁图长度分别为301.6cM、316.9cM、320.5cM、173.7cM,虽然4条连锁图的长度与英国罗斯林研究所公布的最新的绵羊遗传连锁图不同,但标记顺序相同。 利用QTL express在线分析程序,选择半同胞家系模型,用区间作图法对影响上述凉山半细毛羊5个体重性状和8个羊毛性状的数量性状位点进行了QTL定位分析。QTL定位结果显示: 在1号染色体检测到了4个OTL位点,分别是187家系在255cM处检测到影响断奶重的QTL,并达到了显着水平;在家系187中249cM处检测到影响育成羊剪毛量的QTL,在999家系检测到2个QTL位点,分别为在155cM处检测到的影响育成羊腹毛长的QTL和149cM处检测到的影响成年羊腹毛长的OTL位点,但后面3个OTL位点
张翔宇[10](2006)在《凉山半细毛羊微卫星多态性与体重性状的相关分析》文中认为为研究凉山半细毛羊微卫星基因多态性分布及其与体重性状的相关性,选择1,2,3,9号染色体的22个微卫星标记,采用FAM、TET和HEX3种不同颜色的荧光染料标记微卫星引物,对凉山半细毛羊187个个体的基因组DNA进行多重PCR扩增,扩增产物在ABI310测序仪上经变性聚丙烯酰胺凝胶毛细管电泳,检测结果通过GeneScan3.0、Genotyper2.5、Cervus2.0、SAS6.12等软件进行数据分析。表型性状包括羔羊初生重(Birth weight),断奶重(Weaning weight,4月龄),断奶日增重(Weaning daily gain),18月龄体重(18-month weight)。 所选微卫星标记在凉山半细毛羊群体中平均检测到9个(3~17个)等位基因,平均多态信息含量为0.697(0.455~0.861),群体杂合度平均值为0.733(0.51~0.876)。22个标记均呈现高度或中度多态性,为该群体分子水平上的研究提供了可靠的依据。 对试验群体187个后代的体重性状表型资料进行了统计分析。相关分析的结果表明:断奶重与初生重、18月龄体重间存在极显着的正相关,断奶重与断奶日增重只存在显着正相关;初生重与18月龄体重间存在显着正相关。通过标记与性状的关联分析表明:6个微卫星标记分别与不同的体重性状相关,其中微卫星BMS1126和BMS835与初生重相关,BMC1009、ILSTS0049和OarCP0079与断奶重相关,BMS1126、BMS1248和OarCP0079与断奶日增重相关。同时对性状相关显着的标记进行不同基因型间的多重比较,结果发现:标记BMS835中AD、DD、DI基因型,标记BMS1126中BI基因型对初生重影响显着;标记BMC1009中DE、AD基因型,标记ILSTS0049中BD、DD、AC基因型,标记OarCP0079中EF、CF基因型,标记BMS1126中DG基因型对断奶重影响显着;标记BMS1248中EE、DF基因型,标记OarCP0079中CC基因型,标记BMS1126中DG基因型,标记ILSTS0049中AC基因型对断奶日增重影响显着;标记BM1577各基因型对18月龄体重影响显着。 目前我国对绵羊的基因组研究和数量性状的定位还处于起步阶段,本实验不仅为我国在此领域的研究进行了有益的探索,而且为进一步的QTL定位和标记辅助选择提供可靠的依据。
二、凉山半细毛羊QTL作图研究进展(论文开题报告)
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、凉山半细毛羊QTL作图研究进展(论文提纲范文)
(1)凉山半细毛羊3号染色体体重性状QTL定位研究(论文提纲范文)
1材料与方法 |
1. 1群体及性状 |
1. 2 DNA提取 |
1. 3引物设计 |
1. 4 PCR扩增与检测 |
1. 5 ABI310检测 |
1. 6微卫星分析 |
1. 7连锁图谱构建 |
1.8 QTL定位 |
2结果与分析 |
2. 1扩增产物的检测 |
2. 2标记信息 |
2. 3构建连锁图谱 |
2. 4 QTL定位 |
3讨论 |
3. 1资源参考群体 |
3. 2遗传标记 |
3. 3 QTL定位的可靠性 |
(2)四川省绵羊资源的发掘与评估初探(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
1. 文献综述 |
1.1 四川省现有绵羊资源现状 |
1.1.1 四川省绵羊的生产概况 |
1.1.2 四川省的绵羊种质资源 |
1.2 绵羊资源的遗传多样性 |
1.2.1 DNA分子水平的研究概况 |
1.2.2 分子标记的应用 |
1.3 绵羊生产性能及肉质研究的概况 |
1.3.1 绵羊生产性能研究概况 |
1.3.2 绵羊肉质的研究概况 |
1.4 绵羊的杂交改良研究概况 |
1.5 绵羊资源的研究发展趋势 |
1.5.1 绵羊品种资源的保护 |
1.5.2 绵羊资源的充分利用 |
1.6 本试验研究的目的意义 |
2. 材料与方法 |
2.1 试验材料 |
2.1.1 试验群体及方法 |
2.1.2 试验试剂及仪器 |
2.1.3 绵羊资源材料与方法 |
2.2 布拖黑绵羊与凉山半细毛羊改良羊生长发育及肉质比较分析方法 |
2.2.1 绵羊生长发育指标 |
2.2.2 绵羊屠宰性能测定 |
2.2.3 羊肉品质分析比较 |
2.2.4 常规营养成分分析 |
2.2.5 绵羊矿物质成分测定 |
2.2.6 羊肉氨基酸成分测定 |
2.2.7 羊肉脂肪成分测定 |
2.2.8 羊肉挥发性成分测定 |
2.3 四川省绵羊资源研究方法 |
3. 结果与分析 |
3.1 布拖黑绵羊与凉山半细毛羊改良羊生长发育和肉质比较试验结果分析 |
3.1.1 生长发育指标 |
3.1.2 屠宰性能和肉质分析 |
3.1.3 常规营养成分分析 |
3.1.4 氨基酸含量分析 |
3.1.5 矿物质含量分析 |
3.1.6 脂肪酸含量分析 |
3.1.7 挥发性成分分析 |
3.2 四川省绵羊资源的调查研究结果初步分析 |
3.2.1 四川绵羊资源基本情况 |
3.2.2 四川绵羊资源生理生化指标 |
3.2.3 四川绵羊资源基本特征描述 |
3.2.4 四川绵羊资源生长发育指标 |
3.2.5 四川绵羊资源繁殖性能 |
3.2.6 四川绵羊资源生产性能 |
3.2.7 四川绵羊资源遗传指标分析 |
3.2.8 四川绵羊资源饲养管理状况 |
3.2.9 四川绵羊资源评估与保存信息 |
4. 讨论 |
4.1 布拖黑绵羊与凉山半细毛羊改良羊生长发育及肉质比较 |
4.1.1 生长发育指标 |
4.1.2 屠宰性能和肉质 |
4.1.3 常规营养成分 |
4.1.4 氨基酸和矿物质含量 |
4.1.5 脂肪酸及挥发性风味物质 |
4.2 四川省绵羊资源的调查研究 |
4.2.1 四川绵羊资源基本情况 |
4.2.2 四川绵羊资源生理生化指标 |
4.2.3 四川绵羊资源基本特征 |
4.2.4 四川绵羊资源生长发育指标 |
4.2.5 四川绵羊资源繁殖性能 |
4.2.6 四川绵羊资源生产性能 |
4.2.7 四川绵羊资源遗传指标 |
4.2.8 四川绵羊资源饲养管理状况 |
4.2.9 四川绵羊资源评估与保存信息 |
5. 结论 |
参考文献 |
致谢 |
攻读学位期间发表的文章 |
(3)绵羊胴体成分性状QTL的元分析及相关基因的克隆、时空表达谱分析(论文提纲范文)
摘要 |
ABSTRACT |
第一章 前言 |
1 研究背景 |
1.1 绵羊基因组中QTL定位结果存在的问题 |
1.2 QTL的整合图谱 |
1.3 整合后QTL的元分析 |
1.4 绵羊的比较基因组图 |
1.5 绵羊胴体成分性状的复杂遗传机理 |
2 本研究的主要目的和内容 |
第二章 文献综述 |
1 绵羊遗传连锁图的绘制 |
1.1 实验群体设计 |
1.2 目前绘制绵羊遗传连锁图的主要资源参考家系 |
1.3 绵羊遗传连锁图的研究进展 |
2 绵羊物理图谱和比较图谱 |
2.1 绵羊物理图谱的研究进展 |
2.2 绵羊比较图谱的研究进展 |
3 绵羊QTL定位的主要方法 |
3.1 候选基因法 |
3.2 基因组扫描法 |
3.2.1 标记分析 |
3.2.2 区间作图法 |
3.2.3 复合区间作图法 |
3.2.4 多区间作图法 |
4 绵羊的网络资源 |
5 生肌调节因子家族研究进展 |
5.1 生肌调节因子家族概述 |
5.2 MYOD基因的研究进展 |
5.2.1 MYOD基因结构与功能 |
5.2.2 MYOD基因的表达及调控因子 |
5.3 MYOG基因的研究进展 |
5.3.1 MYOG基因的结构与功能 |
5.3.2 MYOG基因的突变及其对性状的影响 |
5.4 MYF5和MYF6基因的研究进展 |
5.4.1 MYF5和MYF6基因的结构和功能 |
5.4.2 MYF5和MYF6基因的表达及调控因子 |
5.5 Myostatin基因的研究进展 |
5.5.1 Myostatin基因的结构与功能 |
5.5.2 Myostatin基因的表达及调控因子 |
第三章 胴体性状QTL的元分析及候选基因的关联 |
1 数据和方法 |
1.1 QTL文献信息的收集 |
1.2 QTL定位信息的收集 |
1.3 QTL映射 |
1.4 元分析 |
1.5 胴体相关基因与元QTL的关联分析及位置候选基因的筛选 |
2 结果与分析 |
2.1 影响胴体成分的QTL的整合及在绵羊基因组的分布 |
2.2 影响胴体成分QTL元分析 |
2.3 元QTL与候选基因的关联及位置候选基因的筛选 |
3 讨论 |
3.1 绵羊胴体成分及相关性状的定位结果 |
3.2 QTL的映射整合 |
3.3 QTL的元分析 |
3.4 候选基因与MQTL的关联 |
第四章 MSTN基因和MRF家族的组织和时间表达差异分析 |
1 材料与方法 |
1.1 实验材料 |
1.1.1 样品的采集 |
1.1.2 主要仪器设备和试剂 |
1.1.3 常用试剂的配制 |
1.2 实验方法 |
1.2.1 提取RNA器皿的处理 |
1.2.2 总RNA的提取 |
1.2.3 RNA样品的琼脂糖凝胶电泳检测 |
1.2.4 反转录 |
1.2.5 引物设计 |
1.2.6 常规PCR |
1.2.7 PCR扩增产物的胶回收 |
1.2.8 标准品的制备 |
1.2.9 实时荧光定量PCR |
1.3 数据处理 |
2 结果与分析 |
2.1 组织总RNA提取结果 |
2.2 普通PCR的扩增结果 |
2.3 荧光定量PCR结果 |
2.3.1 扩增曲线和标准曲线 |
2.3.2 扩增产物的特异性 |
2.3.3 日龄及组织差异对MSTN和MRF家族基因表达的影响 |
2.3.4 MSTN基因的组织和日龄特异性表达 |
2.3.5 MYOG基因的组织和日龄特异性表达 |
2.3.6 MYOD基因的组织和日龄特异性表达 |
2.3.7 MYF5基因的组织和日龄特异性表达 |
2.3.8 MYF6基因的组织和日龄特异性表达 |
2.3.9 MRF家族基因肌肉中表达量的相关分析 |
3 讨论 |
3.1 MSTN基因的时间特异性表达 |
3.2 MSTN基因的组织特异性表达 |
3.3 MYOD、MYOG和MYF5基因的时间特异性表达 |
3.4 MYF6基因的时间特异性表达 |
3.5 MRF家族时间特异性表达与家族成员具体功能的联系 |
第五章 绵羊MYOG和MYF6基因cDNA克隆及其序列分析 |
1 材料与方法 |
1.1 实验材料 |
1.2 仪器与试剂 |
1.3 实验方法 |
1.3.1 总RNA的提取 |
1.3.2 RNA样品的琼脂糖凝胶电泳检测 |
1.3.3 引物设计 |
1.3.4 反转录反应 |
1.3.5 RT-PCR扩增 |
1.3.6 PCR扩增检测 |
1.3.7 RT-PCR产物克隆 |
1.3.8 扩增子菌液PCR鉴定 |
1.3.9 测序 |
1.3.10 序列分析及蛋白质预测 |
2 结果与分析 |
2.1 MYOG基因克隆和序列分析 |
2.1.1 RNA提取结果 |
2.1.2 RT-PCR的扩增结果 |
2.1.3 MYOG基因重组菌液PCR的鉴定 |
2.1.4 MYOG基因的序列测定及同源性分析 |
2.1.5 MYOG基因的序列与普通牛的分析 |
2.1.6 MYOG基因的氨基酸序列与普通牛的氨基酸比对 |
2.1.7 MYOG基因编码蛋白质的组成、分子量、等电点的分析 |
2.1.8 MYOG编码蛋白疏水性分析 |
2.1.9 MYOG编码蛋白信号肽分析 |
2.1.10 MYOG编码蛋白跨膜结构分析 |
2.1.11 MYOG编码蛋白糖基化位点预测 |
2.1.12 MYOG编码蛋白质二级结构预测 |
2.1.13 MYOG基因的分子进化分析 |
2.2 MYF6基因克隆和序列分析 |
2.2.1 RNA提取效果 |
2.2.2 RT-PCR的扩增结果 |
2.2.3 MYF6基因重组菌液PCR的鉴定 |
2.2.4 MYF6基因的序列测定及同源性分析 |
2.2.5 MYF6基因的序列与普通牛的分析 |
2.2.6 MYF6基因的氨基酸序列与普通牛的氨基酸比对 |
2.2.7 MYF6基因编码蛋白质的组成、分子量、等电点的分析 |
2.2.8 MYF6编码蛋白疏水性分析 |
2.2.9 MYF6编码蛋白信号肽分析 |
2.2.10 MYF6编码蛋白跨膜结构分析 |
2.2.11 MYF6编码蛋白糖基化位点预测 |
2.2.12 MYF6所编码蛋白质的二级结构预测 |
2.2.13 MYF6基因的分子进化分析 |
2.3 MRF家族基因编码区的同源性分析 |
3 讨论 |
3.1 MYOG基因的序列分析 |
3.2 MYOG基因的多态性 |
3.3 MRF基因家族基因的同源性 |
第六章 结论与展望 |
1 本研究总结 |
1.1 文献信息收集和群体 |
1.2 QTL的映射整合 |
1.3 映射后QTL的元分析 |
1.4 元QTL与候选基因的关联 |
1.5 MSTN的组织和时间差异表达 |
1.6 MYOG、MYOD和MYF5基因的时间差异表达 |
1.7 MYF6基因的时间差异表达 |
1.8 MRF家族时间特异性表达与家族成员具体功能的联系 |
1.9 MYOG和MYF6的CDS区克隆研究 |
2 下一步的研究思路 |
参考文献 |
致谢 |
博士在读期间发表的论文 |
(4)凉山半细毛羊遗传育种数据仓库构建及其数据挖掘(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
第一部分 文献综述 |
1 前言 |
2 决策信息管理系统的发展现状和趋势 |
2.1 从ERP到BI的实现 |
2.1.1 ERP发展概况 |
2.1.2 ERP同EDI的整合 |
2.1.3 在ERP中加强数据仓库和联机分析处理功能 |
2.2 商业智能研究和应用现状 |
2.2.1 商业智能的组成、特点和架构 |
2.2.2 多维数据模型的技术特征 |
2.3 商务智能系统与其他商业决策系统的区别 |
2.4 从事务操作环境到分析操作环境的转变 |
2.4.1 事务操作数据库与数据仓库的区别 |
2.4.2 事务数据库与OLAP的关系 |
2.4.3 数据仓库的概念、特征及其应用 |
2.5 从知识发现到知识挖掘的跨越 |
2.5.1 知识发现催生的数据挖掘 |
2.5.2 数据挖掘的方法 |
2.5.3 数据挖掘的实施流程 |
2.5.4 数据挖掘在生物医学研究中的应用 |
2.5.5 数据挖掘在遗传数据上的作为 |
3 本研究的目的和意义 |
第二部分 材料和方法 |
1 资料来源 |
1.1 系谱资料 |
1.2 生产性能资料 |
1.3 遗传信息资料 |
1.4 凉山半细毛羊遗传育种数据仓库的开发环境和平台 |
2 凉山半细毛羊遗传育种数据仓库的设计 |
2.1 数据仓库的需求分析 |
2.1.1 数据仓库的设计策略 |
2.1.2 数据仓库的需求分析 |
2.2 数据仓库概念模型和逻辑模型设计 |
2.2.1 界定系统的边界 |
2.2.2 确定主题域 |
2.2.3 数据粒度(DataGranularity)层次划分 |
2.2.4 确定数据分割策略 |
2.2.5 关系模式定义 |
2.2.6 数据仓库的运行和维护 |
3 凉山半细毛羊遗传育种数据仓库的实现 |
3.1 数据仓库的逻辑模型结构 |
3.2 数据仓库系统的总体架构 |
3.3 数据预处理 |
3.4 数据仓库的ETL规则实施 |
3.5 数据仓库的实施与生成 |
3.5.1 核心数据集市的设计 |
3.5.2 系谱数据集市的设计 |
3.5.3 体重数据集市的设计 |
3.5.4 羊毛性状数据集市的设计 |
3.5.5 凉山半细毛羊数据集市生成 |
3.6 数据仓库的使用维护、分析挖掘和育种应用 |
3.6.1 数据仓库的使用和维护 |
3.6.2 遗传育种数据的分析挖掘和育种应用 |
第三部分 试验分析 |
1 试验设计分析 |
1.1 数据清洗和数据预处理 |
1.2 设计数据仓库 |
1.3 数据仓库的生成 |
1.4 数据分析和数据挖掘 |
2.试验结果分析 |
2.1 数据仓库中系谱数据集市挖掘分析 |
2.2 数据仓库中体重数据集市挖掘分析 |
2.3 数据仓库中羊毛数据集市的挖掘分析 |
第四部分 讨论 |
1.1 关于生物数据仓库构建和数据挖掘的问题 |
1.2 动物遗传育种数据仓库构建 |
1.3 动物遗传育种数据挖掘 |
1.4 决策支持方法在遗传育种工作上的应用 |
1.5 凉山半细毛羊遗传育种数据仓库系统的数据展现 |
1.6 凉山半细毛羊遗传育种数据仓库系统的探索方向 |
第五部分 结论 |
参考文献 |
致谢 |
攻读学位期间发表的学术论文 |
(6)凉山半细毛羊资源参考群信息数据库的初步构建(论文提纲范文)
摘要 |
ABSTRACT |
1 文献综述 |
1.1 数据库技术及生物数据库简介 |
1.1.1 数据库基本知识 |
1.1.2 数据管理技术的产生和发展 |
1.1.2.1 人工管理阶段 |
1.1.2.2 文件系统阶段 |
1.1.2.3 数据库系统阶段 |
1.1.3 Web技术简介 |
1.1.4 生物数据库简介 |
1.1.4.1 生物数据库和生物信息学的发展 |
1.1.4.2 重要的生物数据库简介 |
1.2 凉山半细毛羊简介及目前的研究情况 |
1.2.1 凉山半细毛羊概述 |
1.2.2 凉山半细毛羊目前研究情况 |
1.2.2.1 目前绵羊基因组作图研究的主要资源参考家系 |
1.2.2.2 亲子鉴定 |
1.2.2.3 遗传多样性评估 |
1.2.2.4 绵羊遗传连锁图谱的构建 |
1.2.2.5 定位功能基因及QTL |
1.2.2.6 绵羊羊毛性状和体重性状的相关分析 |
2 研究目的和意义 |
3 资料来源与方法 |
3.1 资料来源 |
3.2 凉山半细毛羊信息系统建立 |
3.2.1 数据库设计思路 |
3.2.2 需求分析 |
3.2.3 模块设计 |
3.2.4 窗体的实现 |
3.2.5 系统集成的实现 |
3.2.6 数据访问页的制作和使用 |
3.2.6.1 创建数据访问页 |
3.2.6.2 美化数据访问页 |
3.6.2.3 使用数据访问页 |
3.3 凉山半细毛羊Web系统简介 |
3.3.1 总体设计原则 |
3.3.2 系统开发工具 |
3.3.3 软件设计步骤和系统界面设计 |
3.3.4 数据库的访问 |
3.3.5 管理系统 |
3.3.6 系统介绍 |
4. 凉山半细毛羊信息系统简单应用实例 |
5. 讨论 |
5.1 数据库的选择 |
5.2 数据的收集和整理 |
5.3 数据输入 |
5.4 提高Access数据库的效率 |
5.5 几点体会 |
5.6 今后的工作 |
6. 结论 |
参考文献 |
致谢 |
附表一 |
附表二 |
(7)微卫星标记多态性及其与凉山半细毛羊体重性状相关关系研究(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
1. 文献综述 |
1.1 绵羊品种资源的起源和特性等概况 |
1.1.1 绵羊的起源 |
1.1.2 绵羊的物种特性及品种分布 |
1.1.3 我国绵羊资源的状况 |
1.1.4 凉山半细毛羊的概况 |
1.2 家畜体重性状的研究进展 |
1.2.1 传统育种方法在家畜体重中的研究 |
1.2.2 遗传标记在家畜体重研究中的应用 |
1.3 微卫星DNA及微卫星DNA遗传标记在动物遗传育种中的应用 |
1.3.1 微卫星DNA的发现与命名 |
1.3.2 微卫星DNA的结构、分布及遗传特点 |
1.3.3 多态性及形成机制 |
1.3.4 微卫星多态性的主要统计参数 |
1.3.5 多态性检测原理和流程 |
1.3.6 微卫星位点的检测方法和标记分析 |
1.3.7 微卫星DNA功能 |
1.3.8 微卫星遗传标记在动物遗传育种中的应用 |
1.4 运用微卫星标记进行凉山半细毛羊体重性状QTL定位研究进展 |
1.5 数量性状与遗传标记之间相关研究的意义和方法 |
1.5.1 数量性状与遗传标记之间相关研究试验设计 |
1.5.2 数量性状与遗传标记相关分析的主要方法 |
1.6 目的与意义 |
2. 试验材料与方法 |
2.1 试验材料 |
2.1.1 试验群体 |
2.1.2 绵羊耳组织采集方法 |
2.1.3 试验分析的表型性状 |
2.1.4 主要仪器设备 |
2.1.5 主要试剂和酶 |
2.1.6 溶液的配制 |
2.2 试验方法 |
2.2.1 表型资料的获得 |
2.2.2 基因组DNA的提取 |
2.2.3 基因组DNA的检测 |
2.2.4 标记的选择和引物的合成 |
2.2.5 PCR反应程序和反应体系 |
2.2.6 PCR产物的检测 |
2.2.7 统计分析 |
3. 结果与分析 |
3.1 生长曲线 |
3.2 各体重性状的简单统计分析 |
3.3 凉山半细毛羊各体重性状间的表型相关分析 |
3.4 DNA提取结果 |
3.5 PCR产物的电泳结果及多态性 |
3.6 凉山半细毛羊15个微卫星座位的等位基因及其基因型频率 |
3.7 凉山半细毛羊的观察杂合度、期望杂合度和多态信息含量 |
3.8 凉山半细毛羊的有效等位基因数 |
3.9 利用一般线性模型对15个微卫星标记不同基因型进行不均衡数据方差分析 |
3.10 微卫星座位不同基因型多重比较 |
3.10.1 标记BMS0460在初生重性状上的多重比较 |
3.10.2 标记RM150在断奶重性状上的多重比较 |
3.10.3 标记RM150和AE25在断奶日增重性状上的多重比较 |
3.10.4 标记BL0004、BMS1248和BMC1009在1.5岁体重性状上的多重比较 |
3.10.5 标记BMS1953在2.5岁体重性状上的多重比较 |
4. 讨论 |
4.1 基因组DNA的提取 |
4.2 关于微卫星标记的选择问题 |
4.3 关于微卫星保守性 |
4.4 关于PCR条件 |
4.5 有关聚丙烯酰胺凝胶电泳 |
4.5.1 PAGE的影响因素 |
4.5.2 带型判读和“影子带” |
4.6 关于群体内遗传变异问题 |
4.7 关于标记与性状相联的分析 |
5. 结论 |
参考文献 |
致谢 |
攻读学位期间发表的学术论文 |
(8)微卫星DNA标记与凉山半细毛羊羊毛性状关系的研究(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
1 文献综述 |
1.1 凉山半细毛羊的发展状况 |
1.2 分子遗传标记及其发展 |
1.3 微卫星DNA标记的特点 |
1.3.1 微卫星DNA数量多且在基因组中分布均匀 |
1.3.2 微卫星DNA具有特异性 |
1.3.3 微卫星DNA具有多态性 |
1.3.4 微卫星DNA容易检测 |
1.4 微卫星DNA标记在绵羊遗传育种中的应用 |
1.4.1 构建绵羊基因组连锁图 |
1.4.2 用于制作绵羊DNA指纹图 |
1.4.3 评估绵羊遗传多样性,估测绵羊品种间的遗传距离 |
1.4.4 绵羊亲子关系的鉴定 |
1.4.5 用于绵羊标记辅助选择 |
1.4.6 用于绵羊功能基因定位及QTL分析 |
1.4.7 用于绵羊杂种优势预测 |
1.5 绵羊羊毛的生产及研究状况 |
1.5.1 中国绵羊羊毛生产简况 |
1.5.2 绵羊羊毛性状的研究现状 |
1.6 本研究的目的和意义 |
2 材料与方法 |
2.1 试验材料 |
2.1.1 试验群体 |
2.1.2 耳组织采集 |
2.1.3 试验研究的表型性状 |
2.1.4 主要仪器设备 |
2.1.5 主要试剂及配制 |
2.2 试验方法 |
2.2.1 微卫星标记的选择与引物合成 |
2.2.2 样品DNA的提取 |
2.2.3 基因组DNA的检测 |
2.2.4 PCR反应体系和反应条件 |
2.2.5 琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物 |
2.2.6 12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 |
2.2.7 聚丙烯酰胺凝胶染色 |
2.3 数据分析 |
2.3.1 等位基因频率及基因型频率 |
2.3.2 遗传杂合度(heterozygosity,H) |
2.3.3 多态信息含量(polymorphism information content,PIC) |
2.3.4 各位点与羊毛性状的相关分析 |
3 结果与分析 |
3.1 基因组DNA抽提结果 |
3.2 琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物的结果 |
3.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳对PCR扩增产物的分型结果 |
3.4 羊毛性状表型资料汇总统计分析 |
3.5 各微卫星位点的群体遗传学分析 |
3.5.1 遗传特性分析 |
3.5.2 等位基因频率与基因型频率 |
3.6 各微卫星标记与羊毛性状的相关分析 |
3.6.1 标记的多态性与羊毛性状的相关关系 |
3.6.2 呈显着相关的标记位点各基因型间分析 |
4 讨论 |
4.1 试验分析技术 |
4.1.1 试验设计 |
4.1.2 PCR反应体系与条件的确定 |
4.1.3 微卫星带型的判读 |
4.1.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳的条件 |
4.1.5 选择聚丙烯酰胺凝胶电泳检测PCR扩增产物 |
4.2 微卫星标记与羊毛性状 |
4.2.1 微卫星标记的选择 |
4.2.2 表型资料统计分析 |
4.2.3 微卫星标记的多态性分析 |
4.2.4 群体的杂合度 |
4.2.5 微卫星标记与羊毛性状的相关分析 |
5 结论 |
参考文献 |
致谢 |
攻读学位期间发表的学术论文 |
(9)凉山半细毛羊QTL定位初步研究(论文提纲范文)
摘要 |
ABSTRACT |
目录 |
第一部分 文献综述 |
1 微卫星标记的研究进展及应用 |
1.1 微卫星标记的形成与消亡 |
1.2 微卫星标记的分布和功能 |
1.3 微卫星位点的分离方法 |
1.4 微卫星标记的遗传特点 |
1.5 微卫星标记的缺陷 |
1.6 微卫星标记在动物遗传育种中的应用 |
2 绵羊遗传连锁图谱研究进展 |
2.1 遗传标记的选择 |
2.2 作图群体 |
2.3 绵羊遗传连锁图谱的研究进展 |
2.4 绵羊物理图谱和比较图谱 |
3 绵羊体重和羊毛性状的研究概况 |
3.1 体重性状的研究 |
3.2 羊毛性状的研究 |
4 绵羊QTL定位研究进展 |
4.1 QTL定位的常用方法 |
4.2 QTL定位分析软件及网络资源 |
4.3 绵羊QTL定位研究的进展 |
5 本研究的立题背景和研究的目的意义 |
第二部分 材料与方法 |
1 实验材料 |
1.1 试验群体 |
1.2 耳组织采集 |
1.3 主要仪器设备 |
1.4 主要试剂及配制 |
2 实验方法 |
2.1 表型资料的测定 |
2.2 样品DNA的提取 |
2.3 微卫星标记的选择与引物合成 |
2.4 PCR反应体系和反应条件 |
2.5 PCR产物检测 |
2.6 数据分析方法 |
第三部分 结果与分析 |
1 基因组DNA抽提及微卫星DNA扩增结果 |
1.1 基因组DNA抽提结果 |
1.2 PCR扩增产物用琼脂糖凝胶电泳检测的结果 |
1.3 PCR扩增产物用ABI310测序仪检测的结果 |
2 微卫星标记基因分型结果 |
3 凉山半细毛羊亲子鉴定的结果 |
4 表型资料统计分析结果 |
4.1 表型资料简单统计分析 |
4.2 相关系数计算结果 |
4.3 各性状在不同家系影响下的方差分析结果 |
4.4 最小二乘分析结果 |
5 凉山半细毛羊遗传连锁图谱 |
6 1、2、3、9号染色体羊毛和体重QTL定位结果 |
6.1 1号染色体QTL定位结果 |
6.2 2号染色体QTL定位结果 |
6.3 3号染色体QTL定位结果 |
6.4 9号染色体QTL定位结果 |
第四部分 讨论 |
1 关于实验方法的讨论 |
1.1 试验材料的采集与基因组DNA抽提 |
1.2 多重PCR体系的建立 |
1.3 关于PCR产物的检测 |
2 关于微卫星标记的选择 |
3 关于实验群体的讨论 |
3.1 用于QTL研究的资源参考群体 |
3.2 关于亲子鉴定的讨论 |
4 关于凉山半细毛羊的体重性状和羊毛性状 |
5 关于遗传连锁图谱构建的讨论 |
6 关于QTL定位的讨论 |
6.1 关于QTL定位的结果 |
6.2 关于QTL定位方法的讨论 |
6.3 关于QTL分析的准确性探讨 |
6.4 从QTL到基因 |
7 展望 |
第五部分 结论 |
参考文献 |
致谢 |
附录 |
(10)凉山半细毛羊微卫星多态性与体重性状的相关分析(论文提纲范文)
中文摘要 |
Abstract |
1 文献综述 |
1.1 微卫星标记的研究进展 |
1.1.1 微卫星位点的多态性及形成机制 |
1.1.2 微卫星位点的保守性 |
1.1.3 微卫星的应用 |
1.2 体重性状的遗传参数估计 |
1.2.1 遗传力 |
1.2.2 遗传相关 |
1.2.3 重复力 |
1.3 标记-性状关联的检测 |
1.3.1 以数量性状为基础的分析法 |
1.3.2 以分子标记为基础的分析法 |
1.4 绵羊遗传连锁图的构建及研究进展 |
1.4.1 遗传连锁图的构建 |
1.4.2 绵羊遗传连锁图的研究进展 |
1.5 绵羊 QTL定位的研究进展 |
1.6 实验的目的及意义 |
2 材料与方法 |
2.1 试验材料 |
2.1.1 试验群体 |
2.1.2 耳组织采集方法 |
2.1.3 实验研究的表型性状 |
2.2 试验方法 |
2.2.1 DNA的提取 |
2.2.2 微卫星标记的选择与引物合成 |
2.2.3 PCR反应体系和反应条件 |
2.2.4 PCR产物检测 |
2.2.5 数据分析 |
3 结果与分析 |
3.1 扩增产物的检测结果 |
3.2 体重表型资料统计分析结果 |
3.2.1 表型资料简单统计分析 |
3.2.2 表型资料相关分析 |
3.3 各标记等位基因数、等位基因频率、杂合度、多态信息含量 |
3.4 微卫星基因座各基因型间体重差异的方差分析 |
3.5 不同微卫星基因型间体重差异的多重比较 |
4 讨论 |
4.1 荧光引物设计 |
4.2 多重 PCR体系的构建 |
4.3 多重PCR扩增产物的检测 |
4.4 群体遗传结构和遗传变异 |
4.4.1 微卫星位点多态性与群体遗传变异 |
4.4.2 微卫星标记的Hardy-Weinberg平衡 |
4.5 体重性状间的相关分析 |
4.6 微卫星标记与体重性状的相关分析 |
5 结论 |
附表 |
参考文献 |
致谢 |
四、凉山半细毛羊QTL作图研究进展(论文参考文献)
- [1]凉山半细毛羊3号染色体体重性状QTL定位研究[J]. 周明亮,杨平贵,吴登俊. 西南农业学报, 2014(01)
- [2]四川省绵羊资源的发掘与评估初探[D]. 陈华丽. 四川农业大学, 2013(03)
- [3]绵羊胴体成分性状QTL的元分析及相关基因的克隆、时空表达谱分析[D]. 张翔宇. 四川农业大学, 2009(06)
- [4]凉山半细毛羊遗传育种数据仓库构建及其数据挖掘[D]. 童恒星. 四川农业大学, 2008(07)
- [5]绵羊经济性状QTL定位的研究进展[A]. 郭婷婷,张英杰,刘月琴. 全国养羊生产与学术研讨会议论文集(2007-2008), 2008
- [6]凉山半细毛羊资源参考群信息数据库的初步构建[D]. 余敏. 四川农业大学, 2007(02)
- [7]微卫星标记多态性及其与凉山半细毛羊体重性状相关关系研究[D]. 郭蓉. 四川农业大学, 2007(02)
- [8]微卫星DNA标记与凉山半细毛羊羊毛性状关系的研究[D]. 胡蓉. 四川农业大学, 2007(02)
- [9]凉山半细毛羊QTL定位初步研究[D]. 李辉. 四川农业大学, 2006(12)
- [10]凉山半细毛羊微卫星多态性与体重性状的相关分析[D]. 张翔宇. 四川农业大学, 2006(12)